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针对美国国防部表示，解放军在南海(专题)取走美军水下无人潜艇，美国政府已向北京正式提出外交照会抗议，要求立即交还。对此，中国南海研究院长吴士存今出席《环球时报》年会受访研判，显然美军水下无人潜艇一来是来进行解放军南海岛礁建设情报侦察；二来则可能是观测三亚核潜舰基地及潜舰航线，美军水下无人潜水艇已对中国安全已造成威胁。
吴士存表示，美军水下无人潜艇是新的情搜方式，到底来干什么，相信美方自己心知肚明；去年美军在南海所进行海空侦察共1200多次，解放军皆有方法反制，水下潜艇是新的方式，故中方扣留水下潜艇是有道理的。
有关双方海权画分，吴士存指出，沿岸国家对专属经济海域拥有海洋科学研究、海底电缆铺设及人工设施建设等，皆拥有排他性管辖权，但就军事测量船这一类，则不须经过沿岸国家同意，所以美国就用国际海域这个一家之词，合理化自身的行为。
吴士存表示，中方在海权画分问题上一直持保留意见，从事军事活动前提是专属经济区必须和平利用，必须不得对沿岸国家安全主权造成威胁，美军水下无人潜艇进入九段线内，并非如同美国所说的测量南海盐度及海水温度，这些公开资料都有。
